La Fundación Rioja Salud se constituyó como Fundación el 3 de diciembre de 2001 e inicia su actividad en junio de 2002 con la apertura de las Unidades Móviles de Cuidados Paliativos y el Área de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas.

A partir de enero de 2003, la Fundación Rioja Salud accede a desarrollar el Programa de Detección Precoz de Cáncer de Mama planificado por la Consejería de Salud. En enero de 2003 comienza, del mismo modo, la actividad la Unidad Hospitalaria de Cuidados Paliativos.

Durante el ejercicio 2004, la Fundación Rioja Salud integra su actividad asistencial en la organización funcional del Servicio Riojano de Salud, aunque mantiene su personalidad jurídica y autonomía de gestión, desarrollando otras actuaciones sanitarias de carácter tecnológico, instando además la implantación de planes de calidad e investigación.

En junio del 2005, el Patronato de la Fundación aprueba la ampliación del objeto fundacional incorporando nuevas proyecciones y horizontes en el ámbito de la sanidad riojana y cuya integración resultan indispensables en Rioja Salud. Así, el objeto fundacional incluye entre otras actividades la promoción de la donación en general y en especial, la donación de sangre así como la gestión de su transfusión, su análisis y del plasma sanguíneo y la gestión del futuro Banco de Sangre.

En el año 2005 se acomete la construcción de las obras del Centro de Investigación Biomédica de La Rioja (CIBIR). La recepción del edificio se formaliza el 27 de abril de 2007.

Adicionalmente, a lo largo de los años 2006 y 2007, se van aprobando diversos contratos de equipamiento general y tecnológico con la finalidad de cumplir con el objeto fundacional de búsqueda de la excelencia médica, investigadora y tecnológica.

El año 2007 y coincidiendo con la apertura del CIBIR, se procede a la ubicación en el Centro de la nueva Unidad de Oncología Radioterápica, pionera en La Rioja y se traslada la Unidad de Medicina Nuclear desde el Hospital General de La Rioja. Las Unidades de Mama, Banco de Sangre, Laboratorios de Virología y Anatomía Patológica se ubican en el Hospital San Pedro. La Unidad de Cuidados Paliativos, incluida su área de hospitalización, permanece en el Hospital General de La Rioja.

Durante el año 2007 y primeros meses del año 2008 se inicia la actividad en el área de investigación del CIBIR, con la progresiva incorporación de equipos humanos y acuerdos de investigación con una clara orientación hacia la investigación en enfermedades oncológicas, infecciosas y neurodegenerativas.
En el año 2009 se puso en marcha el animalario con barrera SPF (Specific Pathogen Free), que permite albergar a las diferentes especies utilizadas en los proyectos de investigación, siendo la única instalación de estas características que existe actualmente en La Rioja.

A partir del año 2009, las actuaciones han estado orientadas a la consolidación de los equipos de investigación ya existentes y a la creación de nuevas estructuras, en 5 líneas de trabajo principales:

• Organización de las áreas y servicios específicos del CIBIR
• Desarrollo de las líneas de investigación
• Transferencia del conocimiento
• Colaboraciones y proyección exterior
• Búsqueda de financiación

Dentro del área de Investigación, están constituidos los siguientes comités científicos:

• Comité Ético de Investigación Clínica de La Rioja (CEICLAR).
• Comité Ético de Investigación Animal (CEEA).
• Comité Científico Asesor Externo (Scientific Advisory Board-SAB).

En la parte asistencial, la Ley 7/2011, de 22 de diciembre, de Medidas Fiscales y Administrativas para el año 2012 de la Comunidad Autónoma de La Rioja, incluyó una Disposición Adicional Tercera sobre la integración de las áreas asistenciales de Fundación Rioja Salud en el Servicio Riojano de Salud en los términos siguientes:

1. Las áreas asistenciales de la Fundación Rioja Salud, Cuidados Paliativos, Patología Mamaria, Medicina Nuclear, Centro de Transfusión de Sangre, Unidad de Oncología Radioterápica, Unidad de Protección Radiológica, Diagnóstico Molecular y los laboratorios de virología, anatomía patológica, rehabilitación y admisión quedan integrados funcional y orgánicamente en el Servicio Riojano de Salud.
2. La Fundación Rioja Salud mantendrá su actual régimen jurídico y objeto estatutario en los ámbitos relativos a formación, informática y sistemas de información, la unidad de gestión e investigación biomédica, para todo el Sistema Público de Salud de La Rioja.
   Con fecha 1 de noviembre de 2012 se hizo efectiva la fase de integración funcional de las áreas asistenciales de Fundación Rioja Salud en el Servicio Riojano de Salud, mediante el convenio de colaboración suscrito entre ambas organizaciones.

En el año 2014 el CIBIR se integra en la Red Transfronteriza de Investigación Biomédica de los Pirineos (RefBio), con el objetivo de erigirse como referencia en el espacio transfronterizo de los Pirineos para promover proyectos de investigación competitivos a nivel europeo. Iniciativa que se enmarca en el Programa Operativo de Cooperación Territorial España-Francia-Andorra 2007-2013 (POCTEFA), que acoge en su seno a 8 entidades de investigación biomédica de cinco regiones de ambos lados de los Pirineos.

En enero de 2016, se firmó en París un acuerdo de colaboración con la directora general de Ciencias Humanas y Sociales de la Unesco, en virtud del cual la institución internacional se compromete a prestar toda la ayuda necesaria para constituir un Centro de Documentación e Información en Bioética en el CIBIR, siendo uno de los cuatro centros de estas características acreditados en todo el mundo y el único de habla hispana. De esta forma, el CIBIR se convierte en referencia mundial en materia de bioética en español.

Bajo el lema Objetivo 2022, en mayo de 2017 se presentó el nuevo proyecto que la Fundación Rioja Salud liderará en los próximos cinco años, con el objetivo de consolidarse como motor de la innovación en el sistema público socio-sanitario de La Rioja, propiciando cambio de magnitud que permitan mejorar de forma continua el servicio prestado al ciudadano aplicando criterios de gratuidad, universalidad, excelencia, personalización y humanización, siendo sensibles a las necesidades del territorio, a la agenda poblacional y poniendo a disposición la mejor tecnología disponible y los profesionales mejor formados.

Dentro de la estrategia desarrollada para el periodo 2017-2022, se crea el área de Innovación Sanitaria que identifica cuatro objetivos estratégicos, tres enmarcados en la línea estratégica de Innovación en Salud (ciudadano, organización y recursos)y un cuarto objetivo de gestión de la propia actividad de innovación. Se crea la Comisión de Innovación Sanitaria integrada por expertos en gestión asistencial, clínica, tecnologías y farmacia, destacando entre sus funciones la elaboración de la estrategia de innovación sanitaria, el análisis y selección de ideas y ante-proyectos, el asesoramiento y soporte a los procesos de innovación, la definición y seguimiento de los indicadores de la estrategia y el seguimiento periódico de las actuaciones y proyectos innovadores.

En 2017 fueron publicadas dos expresiones de interés para la concesión de ayudas a grupos de investigación para el desarrollo de proyectos de investigación, desarrollo tecnológico e innovación en el sector biomédico, tanto para el personal investigación como para el personal de sistema público de salud de La Rioja, en el marco del Programa Operativo FEDER La Rioja 2014-2020. Han sido admitidos un total de 28 proyectos con una dotación económica estimada en 3,4 millones de euros.

En 2018 se han adquirido dos nuevos aceleradores lineales Versa HD, por un valor de 4,5 millones de euros, financiados a través del protocolo de intenciones suscrito en mayo de 2017 entre el Gobierno de La Rioja y la Fundación Amancio Ortega Gaona.

En abril de 2018 Fundación Rioja Salud presentó al Gobierno de La Rioja la memoria EFQM, siéndole concedido en el mes de diciembre el certificado a la Excelencia Q de bronce por la Consejería de Administración Pública y Hacienda.

En 2019 se adjudicó el contrato de suministro mediante arrendamiento sin opción de compra de un sistema híbrido de diagnóstico por la imagen Discovery NM/CT 670DR, para la Unidad de Medicina Nuclear del CIBIR, por valor de 704.634,64 €.

En el año 2019 Fundación Rioja Salud ha licitado un expediente en el ámbito de la Innovación Sanitaria sobre TRAZABILIDAD DE PACIENTES EN BLOQUE QUIRURGICO del Hospital San Pedro de La Rioja y otro expediente de Compra Pública Innovadora, compuesto por 4 lotes, de SOLUCIONES DE TELE-MEDICINA para el Sistema Público de Salud de La Rioja.

Premios y reconocimientos recibidos en 2019:

• Premio Plan Nacional de Resistencia a los Antibióticos (PRAN), II edición a la mejor publicación científica sobre resistencia a antibióticos.
• Reconocimiento del Consejo Social de la Universidad de La Rioja en la edición de 2019, por la colaboración de Fundación Rioja Salud y el CIBIR en el ámbito de la investigación.
• Premio a las ciencias del Centro Riojano en Madrid 2019 para la investigadora del CIBIR responsable de la Plataforma de Genómica y Bioinformática.
• Participación en el CIBER de Enfermedades Respiratorias, en coordinación con la Fundación Jiménez Díaz.

En 2020, desde el área de Innovación Sanitaria se ha lanzado una solución de carácter innovador para favorecer la identificación temprana de nuevos casos de COVID-19 y facilitar el estudio de su entorno cercano, con el objetivo de visualizar las cadenas de transmisión y el análisis de la evolución de la enfermedad desde una perspectiva diagnóstica y predictiva. Los resultados de los indicadores son obtenidos mediante varios procesos diferenciados e interrelacionados: Autoevaluación COVID, Gestor casos COVID, Gestor COVID y la herramienta COVID-19 QR.

Los dos investigadores responsables de las unidades de Neurobiología Molecular y Biomarcadores - Señalización Molecular han recibido la ayuda Miguel Servet II del Instituto de Salud Carlos III. Estas ayudas están destinadas a investigadores que hayan disfrutado un contrato Miguel Servet y que tengan una trayectoria investigadora destacada.